Desde el año 1951 , la Misión Salesiana de Bomboiza ha acompañado el caminar del pueblo Shuar en esta región, brindando apoyo en los ámbitos educativo, pastoral y social. En aquellos años, una de las opciones pastorales fundamentales de la Inspectoría Salesiana fue la apertura de internados , con el propósito de ofrecer educación a niños, adolescentes y jóvenes de la zona, asegurando su acceso a una formación integral en un contexto que favoreciera el aprendizaje y el desarrollo personal.

Durante décadas, esta labor educativo-pastoral se realizó en corresponsabilidad entre los Salesianos de Don Bosco y las Hijas de María Auxiliadora (FMA) , quienes compartieron su misión hasta el año 2011 , cuando la comunidad de religiosas y el internado de señoritas cesaron su presencia en la localidad.

Sin embargo, la misión pastoral en Bomboiza ha seguido evolucionando y adaptándose a los nuevos desafíos. En el año 2022 , con la llegada de las Hijas del Divino Salvador , se dio un nuevo impulso a esta labor con la reapertura del internado para señoritas . A partir de este momento, la tarea educativa-pastoral se comparte entre los Salesianos de Don Bosco y las Hijas del Divino Salvador , consolidando un modelo de acompañamiento que responde a las necesidades actuales de los jóvenes.